- Es tracta d'una assignatura eminentment pràctica. L'objectiu és que l'alumne posi en pràctica una sèrie de tècniques analítiques que s'utilitzen rutinàriament per a l'anàlisi i control microbiològic d'aliments així com educar-lo en el treball diari en el laboratori de diagnòstic microbiològic, tant pel que fa a la preparació de medis de cultiu, aïllament i cultiu de microorganismes com per les diferents estratègies d'identificació d'aquests en funció del tipus de mostra sobre el qual s'efectua l'analítica.

- S'estudien els fonaments teòrics de la tècnica microbiològica pel que fa a la purificació, aïllament i cultiu de microorganismes, tipus de medis de cultiu i tècniques de diagnòstic. D'altra banda també s'estudien alguns conceptes bàsics sobre Microbiologia Mèdica i Sanitària.

- L'objectiu de les pràctiques de l'assignatura d'Anàlisis Microbiològiques és familiaritzar l'alumne amb els mètodes comuns d'anàlisi de microorganismes, mitjançant l'estudi de diferents tipus de mostres. Inevitablement, no es tracten totes les possibilitats existents en el camp de la microbiologia diagnòstica, però creiem i confiem que la visió que podreu assolir en aquest camp serà prou àmplia per permetre-us:

1. Enfrontar-vos a la major part dels protocols d'anàlisis microbiològiques
2. Diferenciar un protocol qualitatiu d'un quantitatiu
3. Diferenciar un protocol d'aïllament
4. Valorar la necesitat de treballar amb cultius purs
5. Disposar de les eines necessàries per suplir les mancances que puguin existir en els procediments de laboratori i adaptar-los a les possibilitats del laboratori en el qual desenvolupeu la vostra tasca en un futur
6. Ser capaç de dissenyar un protocol d'anàlisi per a qualsevol tipus de mostra i paràmetre microbiològic per tal de conéixer si és apta o no per al consum.

PROGRAMA DE TEORIA

I. CONCEPTES GENERALS, TÈCNIQUES DE DIAGNÒSTIC i CONTROL DE QUALITAT

Tema 1. Conceptes bàsics: Esterilitat, desinfecció i antisèpsia. Principals mètodes d’esterilització: agents físics i químics. Substàncies antimicrobianes: tipus i mecanisme d’acció. Aplicacions. Resistències.

Tema 2. Cultiu de Microorganismes: Requeriments nutricionals dels microorganismes. Preparació dels medis i control de qualitat. Tipus de medis de cultiu i utilització. Tècniques de sembra. Obtenció de cultius purs: dilucions seriades i sembres en medi sòlid. Conservació de cultius. Col·leccions de microorganismes.

Tema 3. Recompte de Microorganismes: Recompte de microorganismes: recompte al microscopi i en placa, Nombre

Més Probable, Citometria de Flux. Quantificació de la biomassa: densitat òptica, proteïnes i DNA.

Tema 4. Identificació de microorganismes (I): Identificació microscòpica. Mètodes bioquímics: utilització de substrats, presència d’enzims i detecció de compostos signatura.

Tema 5. Identificació de microorganismes (II): Identificació i diagnòstic basats en tècniques immunològiques. Tipus de immunoassajos. Mètodes moleculars: identificació de seqüències signatura i gens específics.

Tema 6. Control de Qualitat i Bones Pràctiques de Laboratori: Organització i regulació del laboratori diagnòstic. Principis bàsics de qualitat. Avaluació i tècniques de control de la qualitat: materials i mètodes de referència. Intercomparació i calibració d’instruments. Validació de mètodes analítics.

II. MICROBIOLOGIA MÈDICA

Tema 7. Conceptes bàsics: Concepte d’infecció. Símptomes de la infecció. Microorganismes patògens: característiques diferencials i identificació. Processament de mostres. Cultiu d’espècimens. Normativa de seguretat per la manipulació de patògens.

Tema 8. Estratègies de Diagnòstic (I): Infeccions del tracte respiratori i gastrointestinal: Grups de microorganismes implicats. Recol·lecció de mostres, enriquiment, cultiu i identificació de patògens del tracte respiratori i gastrointestinal.

Tema 9. Estratègies de Diagnòstic (II): Infeccions del tracte genito-urinari i del sistema circulatori i nerviós: Grups de microorganismes implicats. Recol·lecció de mostres, enriquiment, cultiu i identificació de patògens del tracte genito-urinari, del sistema nerviós i del sistema circulatori.

III. MICROBIOLOGIA SANITÀRIA

Tema 10. Anàlisi microbiològica d’aigües: Microbiologia d’aigües públiques i de consum. Microorganismes patògens en aigües i malalties associades. Mètodes d’anàlisi i diagnòstic. Identificació dels principals patògens.

Tema 11. Anàlisi microbiològica d’aliments: Microorganismes i aliments. Paràmetres que afecten el desenvolupament microbià en aliments. Degradació i enverinament. Toxiinfeccions i intoxicacions alimentàries. Micotoxines. Presa de mostres i cultiu.

Tema 12. Control microbiològic en la indústria alimentària: Control de producte final. Anàlisi de riscos i control de punts crítics. Anàlisis d’aliments sòlids, líquids i envasats. Mètodes d’anàlisi i diagnòstic ràpid.

PROGRAMA DE PRÀCTIQUES

A continuació teniu el llistat de les pràctiques que es realitzaran en les sessions de laboratori.

Pràctica 1. Aïllament i identificació de Staphylococcus aureus en les fosses nasals.

Pràctica 2. Aïllament i identificació de Salmonella spp. en musclos

Pràctica 3. Recompte d' E. coli en carn per la tècnica de nombre més probable (NMP)

Pràctica 4. Anàlisi microbiològica de l'aigua

Pràctica 5. Quantificació de llevats i fongs filamentosos en taps de suro per a cava

Pràctica 6. Quantificació de la microbiota de la mà

Pràctica 7. Detecció d'agents mutagènics. Test d'Ames

Pràctica 8. Anàlisis clíniques

Pràctica 9. ANÀLISI MICROBIOLÒGICA DE LLET O DERIVATS

La bibliografia a la biblioteca

ADSA-MICRO (1981) Medios de cultivo para microbiología. ADSA-MICRO S.A.

Cochran, W.G. (1977) Sampling Techniques. Wiley series in probability and mathematical statistics-Applied. J.W. 3a. Ed.

Dutka, B.J. (1978) Methods for microbiological analysis of waters, wastewaters and sediments. Environment Canada.

Gerba, C.P. & Goyal, S. M. (eds.) (1982) Methods in Environmental Virology. Microbiology series, Vol. 7. M.D.I.

Gerhardt, P. et al. (eds.) (1994) Methods for general and molecular bacteriology. American Society for Microbiology.

Guinea, J. et al. (1979) Análisis microbiológico de aguas. Aspectos aplicados. Ed. Omega.

Hugi, L.& Russel, A.D. (eds.) (1993) Pharmaceutical microbiology. (5^ed) Blackwell.

Kirsop, B.E. & Snell, J.J.S. (1984) Maintenance of microorganisms. Academic Press.

Koneman, E.W. et al. (1992) Diagnostic Microbiology. (4^ed) J.B. lippincott Company

Lennette, E.H. et al. (1987) Manual de Microbiología Clínica. (4^ed) Ed. Panamericana

MacFaddin, J.F. (1985) Media for isolation-cultivation-identification-maintenace of medical bacteria. (Vol. I). Williams & Wilkin.

Miller, M.B. et al. (1986) Laboratory safety: principles and practices. American Society for Microbiology.

Sancho, J. et al. (eds.) (1980) Microbiologia analítica básica. Editorial JIMS.

L'avaluació de l'assignatura consta de les següents proves:

Crèdits teòrics

1. Examen final de 15 a 20 preguntes curtes  40 %

Crèdits pràctics

1. Examen tipus test (40 preguntes)  30 %
2. Informe de pràctiques + preguntes 20 %
3. Elaboració de protocol de pràctica 9  10 %

Els percentatges es refereixen al valor de cada una de les proves en relació al total de l'assignatura. Totes les proves són obligatòries.