1- Els aminoàcids i la cadena polipeptídica.

Propietats fonamentals dels aminoàcids. L'enllaç peptídic i la cadena polipeptídica.

2- Estructura proteica.

Nivells d'estructuració proteica. Principals tipus d'estructures secundaries. Estructures supersecundaries. Motius. Dominis. Estructura terciaria. Proteïnes fibroses i globulars. Estructura quaternaria.

3- Estabilitat i dinàmica conformacional.

Desnaturalització proteica. Renaturalització. Fluctuacions, flexibilitat i dinàmica conformacional.

4- Modificacions post-traduccionals i evolució proteica.

Plegament i associació de proteïnes "in vitro" i en el medi intracel.lular. Modificacions de grups terminals i de cadenes laterals. Zimògens. Activació en cascada. Glucoproteïnes. Variacions seqüencials en proteïnes relacionades evolutivament. Homologies. Arbres filogenètics.

5- Interaccions proteïna-lligand.

Forces que intervenen en l'associació proteïna-lligand. Propietats dels setis de fixació de lligands en diferents proteïnes. Aplicacions i potencialitat de l'enginyeria de proteïnes.

II- Enzimologia.

6- Enzims, classificació i nomenclatura.

Propietats generals dels enzims. Complex enzim-substrat. Cofactors. Normes de la Comisió Internacional d'Enzims. Principals classes d'enzims.

7- Cinètica enzimàtica.

Mesura de l'activitat enzimàtica. Velocitat inicial. Conceptes de cinètica química i enzimàtica. Equació de Michaelis-Menten. Modificació de Briggs-Haldane.

Inhibició de la catàlisi enzimàtica.Tipus d'inhibició.

8- Modificació de l'activitat enzimàtica.

Modificació per unió de lligands. Cooperativitat. Equació de Hill. Enzims al.lostèrics. Model seqüencial, concertat i multiestat.

9- Especificitat enzimàtica. Mecanismes de catàlisi.

El centre actiu. Acoblament enzim-substrat. Teoria de Fisher i de Koshland. Anàlegs de substrat. Catàlisi àcid-base, electrostàtica i covalent. Exemples. Els ribozims.- Purificació i caracterització de l'alfa-amilasa salivar humana.

Experiment continuat per acostar l'alumne a la tasca real en un laboratori de recerca. Obtenció i purificació parcial de l'alfa-amilasa salivar. Estudi cinètic. Determinació de la constant de Michaelis-Menten i de la Velocitat màxima. Electroforesi en gels de poliacrilamida. Realització d'una memoria escrita.

La bibliografia a la biblioteca

- Cantor, C.R. & Schimmel, P.R. Biophysical Chemistry . Ed. Freeman, N.Y., 1980.

- Palmer, T. Understanding Enzymes. (3er ed.). Ed. Ellis Horwood. England,1991.

- Creighton, T.E. Proteins . Ed. Freeman, New York, 1993.

- Branden & Tooze. Introduction to Protein Structure Ed. Garland Publishing, N.Y.,1991.

- Lesk, A.M. Protein Architecture. A Practical Approach . Ed. Oxford University Press, Oxford, 1991.

General

-Lehninger et al. Principios de Bioquímica (2a ed), Barcelona, Ed Omega, 1993.

- Matthews, C. K.; van Holde, K. E. Biochemistry, Ed. Benjamin /Cummings, 1995.

- Voet, D. & Voet, J. Bioquímica . Ed. Omega, 1992.

- Articles específics del "Investigación y Ciencia" i "Mundo Científico" i d'altres revistes científiques d'especial rellevància.