Estudia

• Introduir l'alumne en l'enginyeria molecular i la química informàtica i computacional, fent ènfasi especialment en l'aplicació d'eines informàtiques al descobriment i desenvolupament de fàrmacs i a la predicció de propietats toxicològiques.

1. Introducció

          1.1. Screening molecular

          1.2. Predicció de l'activitat farmacològica i relacions estructura-propietat

2. Representació d'estructures

          2.1. Representació 2D

          2.2. Representació 3D

          2.3. Bases de dades estructurals i cerques

3. Farmacòfors

          3.1. Farmacòfors a la química informàtica

          3.2. Traçat del farmacòfor

4. Models moleculars i relacions quantitatives d'estructura activitat (QSAR)

          4.1. Introducció a la QSAR

          4.2. Descriptors moleculars

          4.3. Exemples de QSAR

5. Semblança i diversitat molecular

          5.1. Mètodes de semblança

          5.2. Selecció de conjunts moleculars diversos

6. Docking entre lligands i proteïnes

          6.1. Mètodes de docking

          6.2. Mètodes de puntuació

          6.3. Aspectes pràctics del docking

7. Toxicologia in silico

          7.1. La normativa REACH

          7.2. La Toolbox per toxicologia in silico

8. Química computacional. Aplicació de la química teòrica a la química orgànica i la química inorgànica.

9. Mecànica Molecular. Camps de forces. Dinàmica molecular clàssica. Dinàmica molecular quàntica.

• Gasteiger, Johann, Engel, Thomas (2003). Chemoinformatics : a textbook. Weinheim: Wiley-VCH.
• Bajorath, Jürgen (cop. 2004). Chemoinformatics : concepts, methods, and tools for drugdiscovery. Totowa, N.J.: Humana Press.
• Leach, Andrew R., Gillet, Valerie J. (cop. 2003). An Introduction to chemoinformatics. Dordrecht [etc.]: Kluwer Academic Publishers.

Activitats d'avaluació:

La nota de l'assignatura es calcularà a partir de la nota de WebQuest (40%), la nota global dels exercicis que s'han de fer a casa (30%), i la nota global dels informes de pràctica (30%).

Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Només es donarà la nota NP a qui no hagi entregat cap element avaluable durant el curs.

Prerequisits:
Fonaments de química quàntica i de matemàtiques. Un cert coneixement de la llengua anglesa, a nivell de comprensió lectora de textos informàtics i científics, és convenient.