1. BLOC I. FONAMENTS D'ECOLOGIA MICROBIANA
1.1. Introducció a l’Ecologia Microbiana. Context teòric i experimental
1.2. Diversitat Microbiana i problemàtica
1.3. Mètodes d'Estudi
1.3.1. Recol·lecció de mostres
1.3.2. Determinació de l'abundància
1.3.3. Estudi de la diversitat
1.3.4. Determinació de l'activitat microbiana
1.4. Comunitats microbianas (I): Conceptes ecològics i impacte dels factors ambientals
1.5. Comunitats microbianes (II): Diversitat, Equitativitat i Estructura
1.6. Comunitats microbianes (III): Dinàmica
1.7. Models Experimentals
1.8. Interaccions entre poblacions
2. BLOC II. ESTUDI DE CASOS
2.1. Cicle del Carboni i adaptacions metabòliques: Proteorhodopsin-containing marine Flavobacteria (Gómez-Consarnau et al. 2007)
2.1.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 1
2.2. Activitat microbiana en interfases òxico/anòxiques: Epsilonproteobacteria in sulfidic redoxclines (Grote et al., 2008)
2.2.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 2
2.3. Immigració bacteriana i impacte en comunitats microbianes indígenes: Airborne bacterial immingration in high mountain lakes (Hervas et al., 2009)
2.3.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 3
2.4. Cicle del Nitrogen (I): Ammonia-oxidation kinetics and niche-separation of nitrifying archaea and bacteria (Martens-Habbena et al. 2009)
2.4.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 4
2.5. Cicle del Nitrogen (II): Mapping spatial patterns of size and distribution of denitrifying communities in soils (Phillipot et al., 2009)
2.5.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 5
2.6. Ecologia microbiana d'ambients extrems: Korarchaeota in hot springs of Iceland and Kamchatka (Reigstad et al., 2009)
2.6.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 6
2.7. Adaptacions a la oligotròfia: Prokaryotic abundance in mineral water (Wilhartitz et al., 2007)
2.7.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 7
2.8. Ecologia microbiana de les infeccions per patògens: Polymicrobial perspective of pulmonary infections in cyctic fibrosis (Sibley et al., 2008)
2.8.1. Anàlisi i discussió complementària CAS 8
3. BLOC III. TREBALL EXPERIMENTAL (Pràctiques Laboratori)
AVALUACIÓ EN PRIMERA CONVOCATÒRIA
L'assignatura s'avaluarà combinant el treball individual i en grup a través de les diferents activitats programades. Totes les activitats són de caràcter obligatori per a aprovar l'assignatura en primera convocatòria. Cal tenir en compte les següents consideracions.
1) Al ser un sistema combinat, el sol fet de presentar-se a alguna de les activitats (examen test, entrega de l'informe de pràctiques, i l'estudi dels casos) ja COMPORTA UN PRESENTAT en 1ª Convocatòria, encara que l'estudiant finalment decideixi no presentar-se a l'examen final de teoria d'aquesta convocatòria.
2)La contribució de les diferents activitats en la nota final de l'assignatura queda com segueix:
BLOC TEÒRIC: S'avalua a partir de tres activitats: Examen test, Estudi de Casos i Examen final.
a) Examen Test: Representa un 10% de la nota final. Aquesta activitat és obligatòria per aprovar en primera convocatòria i es realitza de forma individual.
b) Estudi de casos: És una activitat que representa un 25% de la nota final de l'assignatura (15% Seminari de Defensa i 10% seminari de disscussió). Es realitza en grup (quatre persones com a màxim). No realitzar aquesta activitat (en alguna de les seves dues variants o en les dues) comporta un 0 i, en conseqüència, la contribució d'aquesta activitat (25%) en la nota final de la 1ª Convocatòria no computaria.
c) Examen Final de teoria: representa un 35% de la nota final. Aquesta activitat és obligatòria per aprovar en primera convocatòria i es realitza de forma individual durant el periode d'avaluació al finald el segon semestre.
BLOC PRÀCTIC: la contribució de la nota de pràctiques en la 1ª convocatòria és del 30%. Aquest valor resulta de la nota de l'informe de pràctiques. L'assistència a les sessions de laboratori i l'entrega de l'informe en termini fixat són condicions obligades per aprovar l'assignatura en 1ª Convocatòria.
La qualificació final es realitzarà en relació als percentatges corresponents aplicats a cada una de les quatre proves programades.
AVALUACIÓ EN SEGONA CONVOCATÒRIA
Optaran a 2ª Convocatòria aquells estudiants que hagin suspés la 1ª Convocatòria o bé no s'hi hagin presentat. L'avaluació en 2ª convocatòria es realitzarà mitjançant un ÚNIC EXAMEN GLOBAL. Aquest examen consistirà en preguntes de desenvolupament sobre TOTS els continguts de l'assignatura (teoria, estudi de casos, i pràctiques). Les preguntes de l'examen es repartiran de manera que reflecteixin de manera proporcional els percentatges de cadascuna de les parts avaluades. Per a la realització d'aquest examen final l'estudiant podrà consultar tot el material bibliogràfic del que disposi (llibres, revistes, apunts, guió de pràctiques, etc.) però no es podrà disposar de suport informàtic de cap mena. La qualificació en 2ª Convocatòria serà la nota que l'estudiant obtingui en aquest examen final global.
Criteris específics de la nota «No Presentat»:
Poden optar únicament a la qualificació de No Presentat en primera convocatòria aquells estudiants que decideixin no realitzar les diferents activitats programades durant el curs. Presentar alguna de les quatre proves programades implica una valoració de l'activitat de l'alumne en primera convocatòria, malgrat que no es presentin la resta de proves. En aquest cas es donarà un valor de 0 a cadascuna de les proves no presentades.