Estudia

• Capacitat per transmetre coneixements i comunicar-se oralment i per escrit
• Capacitat de realitzar treball pràctic de laboratori
• Descriure les principals tècniques de biologia molecular, microbiologia i microscòpia; i nomenar-ne les principals aplicacions.
• Triar les tècniques adequades per a assolir un objectiu concret en el disseny de l’experiment.
• Utilitzar les principals tècniques de biologia molecular
• Utilitzar els principals recursos bioinformàtics emprats a les pràctiques i interpretar correctament els resultats
• Interpretar correctament els resultats de les tècniques analítiques utilitzades

• Aplicar els recursos bioinformàtics per a la cerca d’informació i pel disseny i interpretació dels resultats en assajos de seqüenciació, PCR i NASBA a temps real.

1. FONAMENTS EN TÈCNIQUES D'ENGINYERIA GENÈTICA

          1.1. Amplificació d’ADN

          1.2. Resolució i visualització d’àcids nucleics

          1.3. Clonatge

          1.4. Caracterització gènica

2. TÈCNIQUES AVANÇADES EN GENÒMICA, TRANSCRIPTÒMICA I METABOLÒMICA

          2.1. Identificació i quantificació d’ADN per PCR a temps real

          2.2. Identificació i quantificació d’ARN per RT-PCR i NASBA a temps real

          2.3. Tipificació i identificació de microorganismes i d’organismes d’interès alimentari

          2.4. Detecció i desenvolupament de marcadors moleculars per la identificació i quantificació de microorganismes

          2.5. Hibridació d’àcids nucleics. Arrays

          2.6. Tècniques de separació i anàlisi de proteïnes

          2.7. Tècniques d’anàlisi en metabolòmica

3. TÈCNIQUES AVANÇADES EN MICROBIOLOGIA

          3.1. Sistemes d’identificació i estudis cinètics de microorganismes

          3.2. Sistemes automatitzats en microbiologia

4. TÈCNIQUES AVANÇADES EN BIOLOGIA CEL•LULAR

          4.1. Microscòpia

          4.2. Anàlisi d'imatges

          4.3. Cultius cel·lulars

• Ausubel, Frederick M. (cop. 2002). Short protocols in molecular biology : a compendium ofmethods from Current protocols in molecular biology (5th ed.). New York [etc.]: John Wiley & Sons.
• Avise, John C. (cop. 2004). Molecular markers, natural history and evolution (2nd ed.). Sunderland, Mass.: Sinauer.
• Brown, T. A. (1995). Gene cloning : an introduction (3rd ed.). London [etc.]: Chapman and Hall.
• PCR primer : a laboratory manual (2003). New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press.
• Glick, Bernard R., Pasternak, Jack J. (cop. 2003). Molecular biotechnology : principles and applications ofrecombinant DNA (3rd ed.). Washington: ASM Press.
• Innis, Michael A., Gelfand, David H., Sninsky, John J. (cop.1999). PCR applications : protocols for functional genomics. San Diego: Academic Press.
• Klotz, Martin G., Siliciano, Paul G., Lewin, Benjamin. Genes VI (1998). A Student companion and workbook for Genes VI [of] Benjamin Lewin. Oxford [etc.]: Oxford University Press.
• Lewin, Benjamin (cop. 2001). Genes VII. Madrid: Marbán.
• Smith, C. A., Wood, E. J. (cop. 1998). Biología molecular y biotecnología. Argentina [etc.]: Addison-Wesley Iberoamericana.
• Old, R.W., Primrose, S.B. (1994). Principles of gene manipulation : an introduction to geneticengineering (5th ed.). Oxford [etc.]: Blackwell Scientific Publications.
• Sambrook, Joseph, Russell, David W. (David William), 1954- (cop. 2001). Molecular cloning : a laboratory manual (3rd ed). Cold Spring Harbor: Cold Spring Harbor Laboratory.
• Botwell, David, Sambrook, Joseph (cop. 2003). DNA microarrays : a molecular cloning manual. New York: Cold Spring Harbor Laboratory.
• Molecular biology of the gene (cop. 2004) (5th ed.). San Francisco: Pearson/Benjamin Cummings.
• Westermeier, Reiner, Gronau, Sonja (cop. 2001). Electrophoresis in practice : a guide to methods andapplications of DNA and protein separations (3rd ed.). Weinheim [etc.]: Wiley-VCH.
• The Protein protocols handbook (cop. 1996). Totowa (New Jersey): Humana Press.
• Perera, J., Tormo Garrido, A. i Garcia, J.L. (2002). Ingeniaría genética. Síntesis.
• Biotecnología y alimentos: preguntas y respuestas (2003). SEBIOT.
• Tagu, D. i Moussard, C. (2006). Fundamentos de las técnicas de biología molecular. Acribia.
• Jongen (2005). Improving the safety and fresh fruit and vefetables. Woodhead Publishing.
• Kreuzer H. (2004). ADN Recombinante y Biotecnología: Guía para estudiantes.. Acribia.
• Kreuzer H. (2005). Biology and biotechnology : science, applications, and issues. ASM Press.
• mètodes d'anàlisi en base a ADN i proteïnes. Recuperat , a http://biotech.jrc.it/methodsdatabase.htm
• bancs de seqüències i eines informàtiques. Recuperat , a http://www.ncbi.nih.gov/
• eines informàtiques d'anàlisi de seqüències. Recuperat , a http://www.ebi.ac.uk/
• PCR a temps real. Recuperat , a www.appliedbiosystems.com
• PCR a temps real. Recuperat , a http://www.gene-quantification.de/chemistry.html#amplifluor
• Generic engineering. Recuperat , a http://www.tecnociencia.es/especiales/transgenicos/1.htm
• Trends in Biotechnology. ..
• Information Systems for Biotechnology (ISB) News Report. Virginia University. Recuperat, a http://www.isb.vt.edu
• Bozzola, John J., Russell, Lonnie Dee (cop. 1999). Electron microscopy : principles and techniques for biologists (2nd ed.). Sudbury, MA [etc.]: Jones and Bartlett.
• Herman, Brian (cop. 1998). Fluorescence microscopy (2nd ed.). Oxford: Bios Scientific Publishers.
• Lacey, Alan J. (cop. 1999). Light microscopy in biology : a practical approach (2nd ed.). Oxford [etc.]: Oxford University Press.
• Hayat, M. A. (1989). Principles and techniques of electron microscopy :biological applications (3th ed.). Houndmills: MacMillan Press.
• Rubbi, C.P. (1994). Light microscopy : essential data. Chichester [etc.]: Wiley & Sons.
• Aebi U., Engel A (2001). Atlas of Microscopy Techniques. Academic Press, UK..

Activitats d'avaluació:

Els criteris d'avaluació es basaran en el grau de l'assoliment de les competències descrites en l'assignatura.
La nota final de l'assignatura és el sumatori de la nota obtinguda en la prova presencial (35 %), avaluació continuada (35 %) i la nota obtinguda en els treballs en grup (30 %).
És imprescindible aprovar la prova presencial.

Per si és del vostre interès, us adjunto la pàgina web d'Applied Biosystems on podeu veure la descripció d'una nova metodologia per a seqüenciar basada en la lligació. Aquest mètode requereix clonatge previ dels fragments d'ADN a seqüenciar (el clonatge correspon al tema 1.3 de l'assignatura) i és força complicada. Si a algú li interessa, podem parlar-ne en una tutoria.
http://marketing.appliedbiosystems.com/mk/get/SOLID_KNOWLEDGE_LANDING
(anar a: Di-Base Sequencing and Color Space Analysis)